MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 2893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018625	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018625	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018625	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018625	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018625	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018625	T	7	7	2616	2622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018625	TAT	2	6	3054	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018625	ATT	3	9	3069	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018625	TGT	2	6	3082	3087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018625	T	6	6	3098	3103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018625	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018625	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018625	AATC	2	8	5411	5418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018625	GAAT	2	8	6849	6856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018625	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018625	TGGA	2	8	8668	8675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018625	CTGT	2	8	8678	8685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018625	GT	3	6	8684	8689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018625	AGG	2	6	8707	8712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018625	CCT	2	6	8764	8769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_018625	AAG	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018625	GTT	2	6	8836	8841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018625	T	6	6	8840	8845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018625	AAT	2	6	16847	16852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018625	TTA	2	6	16927	16932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018625	AAT	2	6	17005	17010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018625	TAAA	2	8	17021	17028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018625	TTTC	2	8	17678	17685	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018625	AG	3	6	17694	17699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018625	TCC	2	6	18545	18550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_018625	GTT	2	6	20320	20325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018625	TCC	2	6	20326	20331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_018625	TTA	2	6	20336	20341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018625	T	6	6	20375	20380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018625	TCT	2	6	20384	20389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018625	AAT	2	6	20397	20402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018625	TAA	2	6	21720	21725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018625	T	9	9	21767	21775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018625	TAA	2	6	21784	21789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018625	T	6	6	21807	21812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018625	TTC	2	6	23764	23769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018625	T	7	7	23800	23806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018625	A	6	6	23884	23889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018625	AGA	2	6	23899	23904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018625	ATT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018625	T	7	7	26576	26582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018625	TAT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018625	ATTT	2	8	26653	26660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018625	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018625	TTA	2	6	26695	26700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018625	A	6	6	30337	30342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018625	TTTC	2	8	31649	31656	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_018625	AGG	2	6	31743	31748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018625	T	6	6	31767	31772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018625	TC	3	6	31849	31854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018625	AGA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018625	CTT	2	6	31981	31986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018625	GCAG	2	8	32005	32012	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018625	TCTA	2	8	32053	32060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018625	A	6	6	32362	32367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018625	AATT	2	8	32377	32384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018625	AAT	2	6	32406	32411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018625	TTAA	2	8	32417	32424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018625	TTA	2	6	33427	33432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018625	AAG	2	6	33448	33453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018625	A	6	6	33498	33503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018625	TTAA	2	8	33507	33514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018625	TGT	3	9	33521	33529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018625	AGAT	2	8	33550	33557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018625	AAG	2	6	33566	33571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018625	ATTTAA	2	12	33589	33600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018625	TGG	2	6	34223	34228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018625	ATAAA	2	10	34278	34287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018625	A	6	6	34295	34300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018625	TCT	2	6	36468	36473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018625	T	6	6	36509	36514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018625	T	6	6	36519	36524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018625	AGA	3	9	36545	36553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018625	T	8	8	36569	36576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018625	AAT	2	6	36586	36591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018625	TGA	2	6	36609	36614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018625	T	6	6	36647	36652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018625	GCT	2	6	36782	36787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018625	TCC	2	6	36796	36801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_018625	CGCT	2	8	36839	36846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018625	TTC	2	6	37581	37586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018625	TTC	2	6	37622	37627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018625	TGC	2	6	37670	37675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018625	TC	3	6	37732	37737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018625	TCAA	2	8	37771	37778	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018625	AGA	2	6	37860	37865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018625	TCTAG	2	10	37996	38005	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018625	TAT	2	6	38095	38100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018625	GAA	2	6	39472	39477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018625	TTA	2	6	42378	42383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018625	GAA	2	6	42400	42405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018625	AGT	2	6	42689	42694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018625	TTTTAA	2	12	42712	42723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018625	CAA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018625	A	6	6	43429	43434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018625	GTT	2	6	43441	43446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018625	GAC	2	6	44133	44138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018625	ACG	2	6	44168	44173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018625	GTCG	2	8	44191	44198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018625	GTC	2	6	44209	44214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018625	AAGA	2	8	48047	48054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018625	GAA	2	6	49505	49510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018625	ATAA	2	8	49525	49532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018625	A	6	6	49534	49539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018625	TA	3	6	52208	52213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018625	GAT	2	6	52224	52229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018625	TCG	2	6	52291	52296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018625	TTG	2	6	52306	52311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018625	T	6	6	52322	52327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018625	T	8	8	52357	52364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018625	GTC	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018625	A	6	6	52446	52451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018625	TTTTG	2	10	52481	52490	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018625	AAG	2	6	52510	52515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018625	AAAG	2	8	52605	52612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018625	TTTA	2	8	52615	52622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018625	A	6	6	54473	54478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018625	T	7	7	54498	54504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018625	AAT	2	6	54526	54531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018625	AAAG	2	8	54783	54790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018625	TGG	2	6	57857	57862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018625	GAT	2	6	57957	57962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018625	TAA	2	6	57967	57972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018625	GGT	2	6	58086	58091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018625	A	8	8	58095	58102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018625	TCTTT	2	10	59405	59414	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_018625	GGC	2	6	59444	59449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018625	GAG	2	6	59503	59508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018625	ATT	2	6	59552	59557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018625	TTA	2	6	59579	59584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018625	A	6	6	59601	59606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018625	TAA	2	6	59653	59658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018625	AGA	2	6	59729	59734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018625	GTTT	2	8	59889	59896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018625	TATG	2	8	59904	59911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018625	CTA	2	6	59968	59973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_018625	CAA	2	6	63292	63297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018625	TG	3	6	63301	63306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018625	TTG	2	6	64373	64378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018625	A	7	7	64383	64389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018625	GAA	2	6	64400	64405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018625	TCC	2	6	64485	64490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_018625	CTTT	2	8	64563	64570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018625	AAT	2	6	64631	64636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018625	T	7	7	71066	71072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018625	A	7	7	71116	71122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_018625	AATTT	2	10	77737	77746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018625	ATTATA	2	12	77751	77762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_018625	AAT	2	6	93634	93639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018625	TTG	2	6	93672	93677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_018625	GTT	2	6	93951	93956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_018625	TAA	2	6	130777	130782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_018625	TGT	2	6	131442	131447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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